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《尚書》、《詩(shī)經(jīng)》、《國(guó)語(yǔ)》、《左傳》、《史記》和《漢書》等典籍中都有關(guān)于疫情的記載?！段逍兄尽份^為詳細(xì)地記載了傳染病的發(fā)生和防治情形。從各種文獻(xiàn)記載來(lái)看，我國(guó)古代十分注重防治結(jié)合，尤其在國(guó)家安定、力量較強(qiáng)的時(shí)期，對(duì)傳染病的控制最為有效。
東漢時(shí)期是我國(guó)疫病流行的爆發(fā)期，在其立國(guó)195年時(shí)間內(nèi)，見諸史冊(cè)的大型疫病爆發(fā)就有40余次之多，平均4至5年就大規(guī)模爆發(fā)一次，如東漢初年“揚(yáng)徐部大疾疫，會(huì)稽江左甚”、“會(huì)稽大疫，死者數(shù)萬(wàn)”，東漢中期“安帝初，天災(zāi)疫”、“會(huì)稽大疫”、“京師大疫”。
《三國(guó)志·蜀書》中記載：“會(huì)曹公軍不利于赤壁，兼以疫死”?！度龂?guó)志·吳主傳》中也描述：“公燒其余船引退，士卒饑疫，死者大半”， 曹操“于是大疫，吏士多死者，乃引軍還”，可見曹軍的糧草后勤依賴于水路運(yùn)輸，“火燒赤壁”燒掉了曹操的運(yùn)糧船，隨之而來(lái)的缺糧以及疫病爆發(fā)，造成了曹軍大規(guī)模損失。著名的“七步詩(shī)人”曹子建記載得尤為詳細(xì)：東漢末年建安22年（公元217年），中原傳染病大流行，曹植《說(shuō)疫氣》中形容，“家家有僵尸之痛，室室有號(hào)泣之哀?；蜿H門而殪，或覆族而喪。”
上世紀(jì)70年代，考古人員在亳州鳳凰臺(tái)發(fā)現(xiàn)了一座東漢晚期貴族墓，墓主人為丁崇，經(jīng)研究推測(cè)為曹操夫人丁氏的族人，是當(dāng)?shù)赝?。這座墓葬中出土了許多刻有漢字的墓磚、玉器等文物，內(nèi)容深刻反映出當(dāng)時(shí)動(dòng)蕩的社會(huì)狀態(tài)。而其中一對(duì)共刻有66字的玉制文物，真實(shí)反映出古人對(duì)于疫病流行的恐懼心理。其四面均刻有銘文，一件上刻有“正月剛卯既央，靈殳四方，赤青白黃，四色是當(dāng)。帝命祝融，以教夔龍，赤蠖剛癉，莫我敢當(dāng)”34字，因首句中“剛卯”字樣得名”剛卯“。另一件上則刻有“疾日嚴(yán)卯，帝命夔化，填璽固狀，化茲靈殳。既正既直，既觚既方，赤疫剛癉，莫我敢當(dāng)”32字，因首句“嚴(yán)卯”字樣得名“嚴(yán)卯”。 銘文中的“赤蠖、赤疫”指的是給人傳播疫病的惡鬼，而剛癉就是勞累過(guò)度導(dǎo)致的疾病，兩者合用泛指流行疫病。每個(gè)銘文的最后一句皆為“莫我敢當(dāng)”四字，意為這些疫病在“祝融、夔龍”等神明的庇護(hù)下會(huì)遠(yuǎn)離佩戴之人。佩戴剛卯和嚴(yán)卯蘊(yùn)含了古人希望遠(yuǎn)離疫病的美好愿望，據(jù)史書記載，東漢時(shí)期上至百官大臣，下至讀書之人皆佩戴之，可見其盛行一時(shí)，而這也反映出東漢時(shí)期疫病大規(guī)模流行的實(shí)況。
在長(zhǎng)期與自然界斗爭(zhēng)的過(guò)程中，人們總結(jié)出了豐富的防疫經(jīng)驗(yàn)，提出了許多切實(shí)可行的防疫措施與方法，有些至今還流行。蟲蟻、鼠是一些傳染病的傳染源，給人類帶來(lái)了極大危害，在周朝的時(shí)候，人們就用含有碳酸鈣和磷酸鈣的牡蠣及草木灰來(lái)防疫殺蟲，《月令輯要》一書記載：“北人二月二日，皆以灰圍室，云避蟲蟻，又以灰圍倉(cāng)，云避鼠也?！痹诠?世紀(jì)，秦朝政府制定了指定醫(yī)生檢查麻風(fēng)病人的專門法律。
先秦時(shí)期，人們意識(shí)到家禽、牲畜和傳染病的關(guān)系，開始實(shí)行人畜分離，為牲畜設(shè)立單獨(dú)的“圈”。此外，古人對(duì)于飲用水源的保護(hù)也極為重視，例如為井加欄、上蓋，以防止蟲、鼠等掉入，明徐光啟《農(nóng)政全書》有載“冪（蓋）防耗損，亦防不潔”說(shuō)的便是這個(gè)意思，在疫病爆發(fā)時(shí)，也會(huì)將藥物直接撒入井中用來(lái)防疫。到東漢時(shí)，人們已養(yǎng)成了不食病死牲畜的習(xí)慣，如張仲景的《金匱要略·禽獸魚蟲禁忌并治二十四》中便有“肉中有如朱點(diǎn)者，不可食之”、“六畜自死，皆疫死，則有毒，不可食之”的記載。
先秦時(shí)，開始采取將傳染病人隔離的措施，在《睡虎地秦墓竹簡(jiǎn)·法律答問(wèn)》中，秦朝便有將麻風(fēng)病人集中遷移到“癘所”居住的規(guī)定，凡麻風(fēng)病人都要送往“癘遷所”隔離起來(lái)。關(guān)于隔離觀察治療的最早詳細(xì)記載見于《漢書·平帝紀(jì)》:“元始二年,旱蝗,民疾疫者,舍空邸第,為置醫(yī)藥?！?晉朝為保護(hù)皇帝及朝廷官員，規(guī)定官員家中發(fā)生傳染病，如有3個(gè)以上的親屬被傳染，即便官員自己沒有被傳染，也不得入宮，為期100天。而到了南北朝時(shí)期,則已成為制度。蕭齊時(shí),太子長(zhǎng)懋等人曾設(shè)立了專門的病人隔離機(jī)構(gòu)——六疾館，以隔離收治患病之人。
關(guān)于防疫，無(wú)論官方還是民間的努力從未中斷。公元568年，河南汲郡首次出現(xiàn)了寺院傳染病院。在西山寺，僧人們?cè)O(shè)立病房，“收養(yǎng)癘疾”患者。北魏先“于別坊遣醫(yī)救護(hù)”，后又成立醫(yī)館。南齊還出現(xiàn)了私人醫(yī)院，以彌補(bǔ)國(guó)家力量的缺失。隋朝與秦類似，專門為麻風(fēng)病人設(shè)立“癘人坊”。唐朝時(shí)，疫情發(fā)生后，政府采取贈(zèng)藥、埋葬和在交通要道上曉諭藥方的辦法來(lái)加以控制。寺院中設(shè)立醫(yī)院也很盛行，武則天還設(shè)專使加以管理。
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